Zuse bekam insgesamt acht Ehrendocktortitel und zwei Ehrenprofessuren zugesprochen, einer davon ist von der Technischen Universität Dresden von 1981.
1964 Träger des Werner-von-Siemens-Ringes
1969 Wilhelm-Exner-Medaille
1980 Preis der Aachener und Münchner für Technik und angewandte Naturwissenschaften
1981 Ehrendoktorwürde Dr.rer.nat h.c der TU Dresden
1985 Ehrenmitglied der Gesellschaft für Informatik (Verleih der Konrad-Zuse-Medaille aller zwei Jahre seit 1987)
1987 Wilhelm-Leuschner-Medaille
1995 Träger des Bundesverdienstkreuzes mit Stern und Schulterband
1995 Ernennung zum Ehrenbürger der Stadt Hoyerswerda
2002 Widmung des Weimar Universitäts Medizienzentrums an Zuse
2010 Benennung des Hünfelder Stadtplatzes nach Zuses Namen
Zuse-Ausstellungen in den deutschen Museen Berlin, Dresden, Paderborn, Hünfeld, Hoyerswerda und Kiel
Sonderbriefmarke der Deutschen Post mit Zuse aus gerasterten Bildpunkten mit Lebensdaten und Namen.
10-Euro Gedenkmünze zum 100. Geburtstag Zuses
